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根据中央建设创新型国家的总体战略目标和国家中长期科技发展规划纲要，结合科技布局调整的要求，围绕深圳市实施创新型城市战略，2006年2月，深圳市人民政府及香港中文大学友好协商，在深圳市共同建立中国科学院深圳先进技术研究院，实行理事会管理，探索体制机制创新。
中国科学院深圳先进技术研究院实行理事会制度，由中科院和深圳市政府各委派3人组成，实行双组长制，其主要职责是确定年度建设计划。
博士后
2012年8月29日，澳门威尼斯人最新真人：经国家人力资源和社会保障部、全国博士后经管委批准，先进院正式设立“计算机科学与技术”博士后科研流动站，这是深圳市第一个该学科的博士后科研流动站。
2015年获批全国博士后工作站，成为集流动站、工作站一体的博士后培养体系，与中科院华南植物园、中科院西安光机所、广东工业大学在生物、光机电和材料学科方面签署联合培养协议，开展共同招收博士后工作。
